菏澤市科技館是菏澤市民文化中心的重要組成部分，科技館總面積為15700平方米，科技館內設主題展廳和科普影院并配有青少年科技教育工作室、創客工作室等輔助設施。

科技館主題展區，分區清晰，設有兒童科學園、探索發現、生命健康、生態家園、智匯未來及禁毒教育六大主題展廳，展廳中的展品涵蓋材料、機械、航空航天、電子技術、信息通訊、計算機應用、虛擬模擬技術、生命科學、環境科學、基礎科學等多學科領域；科普影院有球幕影院、巨幕影院、4D影院、兒童影院、專業影院等6個特效影院。

一樓展廳是兒童科學園展廳。該展廳主要展示適合三至十歲兒童身心特點的科技內容，設置了大量游樂性很強的參與展項，便于孩子們在探索發現的過程中收獲知識、增強能力、并學會與他人分享合作，兒童科學園展區也為家長和孩子們提供了一個很好的互動學習和實踐的親子場所。

二樓展廳是探索發現展廳，涵蓋了趣味數學、經典物理、物質構成等領域，集中展示了基礎科學原理及其運用，通過神奇的力、電的世界，美妙的光等經典展品讓觀眾感受到科技的美妙與神奇，啟發觀眾去發現并獲得開啟科學大門的鑰匙。